Obiettivo
The recent discovery of a large number of low abundance bacterial phylotypes, coined the ‘rare biosphere’, coexisting next to a few abundant phylotypes raises a number of fundamental questions concerning their role in the microbial food web and their functioning in the biogeochemical cycles, mainly driven by prokaryotes in the ocean. HERA addresses some of these basic questions concerning the role of the ‘rare biosphere’ in coastal European waters using a set of different approaches and recent technological advances. The first approach is to use fractionation of the complex bacterial community by flow cytometry and high speed cell sorting and cell sorting by capillary electrophoresis, the latter based on the specific surface charge of bacteria. This fractionated community will then be subjected to PCR and two fingerprinting techniques, T-RFLP and ARISA. The other approach, to obtain more detailed information on the phylogeny of the ‘rare biosphere’ vs. abundant phylotypes is based on cell sorting of individual populations, enumerating their abundance and using highly multiple displacement amplification (MDA) and subsequently, cloning and sequencing. With this approach, the phylogeny and the abundance of the individual components of the ‘rare biosphere’ will be compared with that of the abundant phylotypes. Leucine incorporation in bacteria and subsequent fractionation will allow comparing the cell-specific growth rates of abundant vs. rare phylotypes. A similar approach is used to determine the phylotype-specific ectoenzymatic activity. Taken together, the combination of approaches will allow us answering some of the fundamental but unsolved questions on the role of the rare biosphere in the microbial food web and in the biogeochemical cycles in coastal seas. The study will be performed over a seasonal cycle hence, we will be able to resolve the enigma whether members of the ‘rare biosphere’ can attain high or low abundance shaping to the organic matter cycling.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche morfologia biochimica morfologia comparativa
- scienze naturali scienze biologiche ecologia
- scienze naturali scienze della terra e scienze ambientali connesse scienze dell'atmosfera meteorologia biosfera
- scienze naturali scienze chimiche elettrochimica elettroforesi
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia batteriologia batteriomi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-IEF-2008
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
1797 SZ DEN HOORN TEXEL
Paesi Bassi
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.