Ziel
The recent discovery of a large number of low abundance bacterial phylotypes, coined the ‘rare biosphere’, coexisting next to a few abundant phylotypes raises a number of fundamental questions concerning their role in the microbial food web and their functioning in the biogeochemical cycles, mainly driven by prokaryotes in the ocean. HERA addresses some of these basic questions concerning the role of the ‘rare biosphere’ in coastal European waters using a set of different approaches and recent technological advances. The first approach is to use fractionation of the complex bacterial community by flow cytometry and high speed cell sorting and cell sorting by capillary electrophoresis, the latter based on the specific surface charge of bacteria. This fractionated community will then be subjected to PCR and two fingerprinting techniques, T-RFLP and ARISA. The other approach, to obtain more detailed information on the phylogeny of the ‘rare biosphere’ vs. abundant phylotypes is based on cell sorting of individual populations, enumerating their abundance and using highly multiple displacement amplification (MDA) and subsequently, cloning and sequencing. With this approach, the phylogeny and the abundance of the individual components of the ‘rare biosphere’ will be compared with that of the abundant phylotypes. Leucine incorporation in bacteria and subsequent fractionation will allow comparing the cell-specific growth rates of abundant vs. rare phylotypes. A similar approach is used to determine the phylotype-specific ectoenzymatic activity. Taken together, the combination of approaches will allow us answering some of the fundamental but unsolved questions on the role of the rare biosphere in the microbial food web and in the biogeochemical cycles in coastal seas. The study will be performed over a seasonal cycle hence, we will be able to resolve the enigma whether members of the ‘rare biosphere’ can attain high or low abundance shaping to the organic matter cycling.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-IEF-2008
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
1797 SZ DEN HOORN TEXEL
Niederlande
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.