Objectif
We propose to study the importance of structural dynamics to enzymatic catalysis. This will utilise simplified model systems in which a variety of catalytically distinct mutants have been generated though directed evolution. This research will focus on whether changes to the conformational landscape of enzymes affect catalysis and how the structural scaffold can determine the optimum temperature for enzymatic activity. Two model systems will be used: (i) the lactate dehydrogenase family, chosen because it is the most heavily studied family with regards to thermophilicity; (ii) a designed Kemp elimination catalyst, chosen because it is the first example of an enzyme in which the evolution of the active site and structural scaffold has been decoupled. A synergistic experimental approach will be used to study the mutants generated through directed evolution: - Biophysics (temperature-controlled cryo-crystallography, incoherent neutron scattering, in-cristallo spectroscopy) and detailed data analysis (anisotropic and multiple crystallographic refinement) - Enzyme kinetics (temperature dependent kinetics and Arrhenius plots) - Computational simulation (normal mode analysis and molecular dynamics) This project will constitute, to our knowledge, one of the first attempts to apply directed evolution to the systematic analysis of the importance and evolution of pathways for dynamic conformational change in enzymatic catalysis.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information science des données
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse
- sciences naturelles sciences biologiques biophysique
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-IIF-2008
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
75794 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.