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Contenuto archiviato il 2024-05-27

Application of directed evolution to the study of structural enzyme dynamics

Obiettivo

We propose to study the importance of structural dynamics to enzymatic catalysis. This will utilise simplified model systems in which a variety of catalytically distinct mutants have been generated though directed evolution. This research will focus on whether changes to the conformational landscape of enzymes affect catalysis and how the structural scaffold can determine the optimum temperature for enzymatic activity. Two model systems will be used: (i) the lactate dehydrogenase family, chosen because it is the most heavily studied family with regards to thermophilicity; (ii) a designed Kemp elimination catalyst, chosen because it is the first example of an enzyme in which the evolution of the active site and structural scaffold has been decoupled. A synergistic experimental approach will be used to study the mutants generated through directed evolution: - Biophysics (temperature-controlled cryo-crystallography, incoherent neutron scattering, in-cristallo spectroscopy) and detailed data analysis (anisotropic and multiple crystallographic refinement) - Enzyme kinetics (temperature dependent kinetics and Arrhenius plots) - Computational simulation (normal mode analysis and molecular dynamics) This project will constitute, to our knowledge, one of the first attempts to apply directed evolution to the systematic analysis of the importance and evolution of pathways for dynamic conformational change in enzymatic catalysis.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-IIF-2008
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IIF - International Incoming Fellowships (IIF)

Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo UE
€ 167 145,57
Indirizzo
RUE MICHEL ANGE 3
75794 PARIS
Francia

Mostra sulla mappa

Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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