Objetivo
The Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) are the main cause of the sequence variability in human. For this reason, the prediction of the impact of SNPs is one of the most challenging problems in computational biology and bioinformatics. The increasing growth of the genome-scale studies is providing a large amounts of SNP data, allowing the application of rigorous statistical approaches for predicting whether a given single point mutation has an effect on human health. In spite of the scientific effort, the identification of disease-associated human SNPs remains a difficult task and a satisfactory solution of general applicability is yet unavailable. This proposal is focused on the study of those SNPs, called missense SNPs (mSNPs), that are responsible of single protein mutation, because the mSNPs can be related to the insurgence of pathologies decreasing the stability or the functional activity of the protein. The main aim of this project concerns the development of new machine learning based methods to predict the effect of a given single point protein mutation. A set of mSNPs corresponding to proteins with known with atomic resolution will be collected and studied evaluating the evolutionary information retrieved using the protein sequences and the structural information derived from the protein 3D structures. The description of the structural and evolutionary related features will allow the implementation of more accurate predictors able to discriminate between disease causing or neutral polymorphisms. In a second part of the project, the resulting predictors will be also used to elucidate the relationships between mSNPs and the resistance to a given drugs. This aspect will be vary important in order to evaluate which therapy could have better effect on a particular phenotype. All the results of this research as well as the implemented predictors will be made available online to scientific community.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias médicas y de la salud medicina básica patología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética nucleótido
- ciencias naturales informática y ciencias de la información inteligencia artificial aprendizaje automático
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-IOF-2008
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
07122 PALMA DE MALLORCA
España
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.