Obiettivo
The Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) are the main cause of the sequence variability in human. For this reason, the prediction of the impact of SNPs is one of the most challenging problems in computational biology and bioinformatics. The increasing growth of the genome-scale studies is providing a large amounts of SNP data, allowing the application of rigorous statistical approaches for predicting whether a given single point mutation has an effect on human health. In spite of the scientific effort, the identification of disease-associated human SNPs remains a difficult task and a satisfactory solution of general applicability is yet unavailable. This proposal is focused on the study of those SNPs, called missense SNPs (mSNPs), that are responsible of single protein mutation, because the mSNPs can be related to the insurgence of pathologies decreasing the stability or the functional activity of the protein. The main aim of this project concerns the development of new machine learning based methods to predict the effect of a given single point protein mutation. A set of mSNPs corresponding to proteins with known with atomic resolution will be collected and studied evaluating the evolutionary information retrieved using the protein sequences and the structural information derived from the protein 3D structures. The description of the structural and evolutionary related features will allow the implementation of more accurate predictors able to discriminate between disease causing or neutral polymorphisms. In a second part of the project, the resulting predictors will be also used to elucidate the relationships between mSNPs and the resistance to a given drugs. This aspect will be vary important in order to evaluate which therapy could have better effect on a particular phenotype. All the results of this research as well as the implemented predictors will be made available online to scientific community.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze mediche e della salute medicina di base patologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica nucleotidi
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale apprendimento automatico
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-IOF-2008
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
07122 PALMA DE MALLORCA
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.