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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-30

Switch recombination: a model system for DNA editing and repair in human lymphocytes with relevance for primary immunodeficiency and cancer formation

Objetivo

The aim of this project is to try to understand the complex molecular mechanisms involved in DNA editing, repair and recombination during immunoglobulin class switch recombination (CSR) and somatic hypermutation (SHM). We have developed a series of PCR-based assays to study in vivo generated CSR junctions and the pattern of mutations introduced in the immunoglobulin variable region genes in human B cells, allowing us to characterize CSR and SHM in patients with immunodeficiency due to defect(s) in DNA repair/recombination. Novel in vitro CSR assays, based on GFP expression, allowing quantitative measurement of substrate recombination, are also being developed. In addition, we have initiated an evolutionary analysis of the function and structure of activation-induced deaminase, an essential molecule involved both in CSR and SHM, aiming to identify CSR specific-cofactor(s). Combining these approaches, we will be able to define the DNA repair pathways involved in CSR and SHM. The suggested project requires access to patients with various defects in the DNA repair pathways. Many of these diseases are exceedingly rare. However, through worldwide collaboration, we have obtained samples from a majority of the diagnosed patients. We are also refining the existing screening methods and developing novel methods, that will allow identification of additional patients both with recognized and new diseases caused by mutations in DNA repair pathways. Finally, we hope to be able to address the question whether illegitimate CSR events are associated with predisposition to lymphomagenesis in patients with immunodeficiency/DNA repair defect(s), by analyzing the CSR induced chromosomal breaks and translocations in these patients. A large-scale sequencing project is also planned to characterize the CSRnome in B-cell lymphoma samples.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

ERC-2009-StG
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Institución de acogida

KAROLINSKA INSTITUTET
Aportación de la UE
€ 1 888 166,00
Dirección
NOBELS VAG 5
171 77 STOCKHOLM
Suecia

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Región
Östra Sverige Stockholm Stockholms län
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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Beneficiarios (1)

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