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Contenido archivado el 2024-06-18

Epigenetic and genome stability: non coding RNA-mediated chromatin modifications in S. cerevisiae

Objetivo

Our project is to understand the role of non coding (nc)RNA in the regulation of epigenetic landscape and gene expression. RNA interference pathway is absent in the budding yeast but recent works from our laboratory showed the existence of an original ncRNA-dependent pathway that controls gene expression in S. cerevisiae. We characterized a cryptic unstable ncRNA mediating the transcriptional silencing of the transposon Ty1 through histone methylation. Furthermore, unpublished data suggest the existence of subtelomeric ncRNAs that might control telomere metabolism and promoter-associated ncRNAs that mediate repressive epigenetic marks. We propose that a class of unstable ncRNA mediates genome expression and fluidity through histone modifications. Following 2 directions, our aim is to systematically identify these ncRNAs (A) and further characterize their regulatory mechanisms (B). (A) First, we aim to identify the regulatory ncRNAs by performing genome-wide approaches in strains accumulating these regulatory ncRNAs. We envisage developing protocols to analyze the cryptic transcriptome using deep sequencing technologies. (B) Second, we will further characterize the previously identified regulatory ncRNAs controlling repetitive regions (Ty1 transposon and telomeric repeats) but also gene expression. Through a range of experimental procedures from living cell biology (Fluorescence Immuno Hybridization), biochemical approaches (RNA-TRAP) and genetic, we will determine the dynamics of the regulatory ncRNA within the cell, the associated proteins that regulate their activities and the chromatin defects resulting from their expression. Our aim is to extensively describe the RNAi-like regulation in S. cerevisiae, that we anticipate to be broadly conserved in other eukaryotes.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

ERC-2009-StG
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Institución de acogida

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Aportación de la UE
€ 1 735 524,00
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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Beneficiarios (1)

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