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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-29

The Exploitation of Formalin Fixed Tissues for High-Throughput Genetic Analyses: An HIV-1-HLA Cointeraction Case Study

Objetivo

The use of formalin-fixed specimens in genetic studies has been limited due to damage of the nucleic acids through contact with the formalin. However, recent developments in extraction and repair techniques have increased both the yields and quality of the DNA and RNA sequences that can be retrieved from such specimens. Additionally, the invention of advanced Multi-Plex PCR techniques has made it possible to quickly screen a large number of genomic markers. Thus, for the first time, formalin-fixed specimens have become available to large-scale genetic analyses.This proposal will enable the principal applicant to become an expert on the retrieval and analyses of nucleic acid from formalin fixed specimens. Based at the University of Copenhagens Centre for Anci ent DNA and Evolutionary Biology, the applicant will be trained by a team of expert mentors in the use, design and theory behind modern high-throughput genetic screening assays for ancient and contemporary DNA. He will also be trained in advanced statistic al and analytical techniques required to develop and analyze the data from genetic association studies. The applicant will apply these techniques to anonymous, HIV-1 infected, fixed biopsy and autopsy specimens that date to the early period of the epidemic in Northern Europe (and lt 1990). Thereby, he will investigate the dynamics of the evolutionary interaction between HIV-1 and the human genome, principally focusing on association studies between the virus and the Human Leukocyte Antigen (HLA) system. The outcomes of this project will not only confirm current hypotheses, and shed new insights, into the model HIV-1-human system, but will develop the tools through which future investigations that require high-throughput screening techniques of fixed specimen s can be achieved.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2004-MOBILITY-5
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinador

UNIVERSITY OF COPENHAGEN
Aportación de la UE
Sin datos
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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