Objectif
The use of formalin-fixed specimens in genetic studies has been limited due to damage of the nucleic acids through contact with the formalin. However, recent developments in extraction and repair techniques have increased both the yields and quality of the DNA and RNA sequences that can be retrieved from such specimens. Additionally, the invention of advanced Multi-Plex PCR techniques has made it possible to quickly screen a large number of genomic markers. Thus, for the first time, formalin-fixed specimens have become available to large-scale genetic analyses.This proposal will enable the principal applicant to become an expert on the retrieval and analyses of nucleic acid from formalin fixed specimens. Based at the University of Copenhagens Centre for Anci ent DNA and Evolutionary Biology, the applicant will be trained by a team of expert mentors in the use, design and theory behind modern high-throughput genetic screening assays for ancient and contemporary DNA. He will also be trained in advanced statistic al and analytical techniques required to develop and analyze the data from genetic association studies. The applicant will apply these techniques to anonymous, HIV-1 infected, fixed biopsy and autopsy specimens that date to the early period of the epidemic in Northern Europe (and lt 1990). Thereby, he will investigate the dynamics of the evolutionary interaction between HIV-1 and the human genome, principally focusing on association studies between the virus and the Human Leukocyte Antigen (HLA) system. The outcomes of this project will not only confirm current hypotheses, and shed new insights, into the model HIV-1-human system, but will develop the tools through which future investigations that require high-throughput screening techniques of fixed specimen s can be achieved.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule acide nucléique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biologie de l'évolution
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2004-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
COPENHAGEN
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.