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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-18

High-throughput sequencing to analyse genome variation and evolution in Map strains

Objetivo

The project proposed for the IEF concerns Mycobacterium avium subsp paratuberculosis (Map) which causes Johne’s disease (JD), a chronic gastroenteritis affecting principally ruminants and responsible for significant global economic losses to the livestock and associated industries. Controversially, Map has been associated with Crohn’s disease in humans. The epidemiology of paratuberculosis is poorly understood and there is little information on the virulence of strain types, interspecies transmission or wildlife reservoirs. The project will analyse genome sequences from 100 Map isolates to study genetic diversity and evolution. An understanding of the evolutionary dynamics of Map populations has important implications for the control of JD and genome information can provide insights into virulence, pathogenicity and host preference. The objectives are to assemble and annotate the genome sequence of a Type I Map strain, to identify single nucleotide polymorphisms that can discriminate the different strain types, human and pigmented isolates and to perform phylogenetic analysis. Few whole genome intraspecies comparisons of pathogenic bacteria have been done on this scale and this will be the first of such studies in mycobacteria. The project employs state-of-the-art technologies for genome sequencing and analyses and has a European dimension. The fellow will acquire crucial new bioinformatics skills and transferable skills that complement her current knowledge and experience to progress her chosen career in the field of evolutionary biology and diversification of pathogens. This will give her a competitive advantage for a senior research position and will promote networking of scientists across Europe, thereby contributing to the European Research Area.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2009-IEF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinador

MOREDUN RESEARCH INSTITUTE
Aportación de la UE
€ 87 370,40
Dirección
Pentlands Science Park, Bush Loan
EH26 0PZ Penicuik
Reino Unido

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Región
Scotland Eastern Scotland East Lothian and Midlothian
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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