Objectif
The relation between structure and functions is a central topic in enzymology. I propose to study that question at the single molecule level employing a novel optical and force spectroscopy. The enzyme will be linked to a glass surface employing PEG-Biotin-Streptavidin interaction. The location of a single enzyme will be determined by a dye attached to it. The substrate of the reaction, while being non-fluorescent, will be chosen so that its enzymatic reaction product is fluorescent. The time span between fluorescence bursts reflecting the distribution of enzymatic active states will indicate the turnover rate of the enzyme. Contrary to the expectation that an enzyme is characterised by a well defined catalytic rate, a stretched exponential function has been reported to be necessary to fit the the probability distribution of the time span between bursts. I will study the effect of temperature on this stretched exponential behaviour for different enzymes. I will explore the enzymes labelled at two specific position by dyes which can act as donor and acceptor for resonance energy transfer (FRET) and the distance dependent FRET efficiency will offer an insight into the conformation fluctuation of the enzyme. In parallel to the optical observation, I will apply a mechanical tension on the enzymes thereby altering the distribution of its active states. In collaboration with the group of Dr. Marc Baaden, starting from the known enzymatic structure we will study numerically how the tension affects the enzymatic conformations. I will study how this tension alters its functions, via the changes in the distribution of turnover times. These studies will offer an insight into the relation between the structural changes of an enzyme and its measured catalytic activity.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
- sciences naturelles sciences physiques optique spectroscopie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IIF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
75794 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.