Objectif
The aim of the proposal is the establishment of a yeast-three hybrid system for the identification of mycobacterial proteins that bind to selected small molecules. It is envisioned to use the system to (i) find targets of active molecules that have been identified in whole cell screenings; (ii) identify mycobacterial proteins that activate or deactivate drugs; (iii) establish simple assays for proteins previously identified as key targets. Since the identification of protein targets of a small molecule drug is challenging, improved methods are asked that facilitate their discovery. With the recent development of an optimised yeast three-hybrid system in the Johnsson group, the stage is set for its application to identify small molecule-protein interactions. This adapted version of the classical yeast two-hybrid system features an additional third synthetic hybrid ligand. It uses SNAP-tag (a self-labelling protein tag) as an anchor protein and O6-benzylguanine (BG) derivatives as synthetic ligands. Currently it allows the screening of human cDNA libraries for small molecule-protein interactions in yeast. To apply this system for drug discovery against tuberculosis, the construction of genomic libraries of M. smegmatis was initiated and libraries of M. tuberculosis will follow. We would start with conjugating known TB drugs (with known or unknown targets) to BG and screen them against genomic libraries. Suggested drugs to start are rifampicin and BTZ as positive controls and clofazimine and thiocarlide as drugs with unclear mechanism of action. Noteworthy that the three-hybrid screen can also be applied for the identification of proteins that activate a certain drug. Furthermore, once a protein-ligand is identified, the hybrid assay can be used to screen for new drugs against this target in HTS compatible competition assay.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie découverte de médicaments
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine clinique pneumologie tuberculose
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Nous sommes désolés... Une erreur inattendue s’est produite.
Vous devez être authentifié. Votre session a peut-être expiré.
Merci pour votre retour d'information. Vous recevrez bientôt un courriel confirmant la soumission. Si vous avez choisi d'être informé de l'état de la déclaration, vous serez également contacté lorsque celui-ci évoluera.
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
Voir d’autres projets de cet appel
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1015 Lausanne
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.