Ziel
The aim of the proposal is the establishment of a yeast-three hybrid system for the identification of mycobacterial proteins that bind to selected small molecules. It is envisioned to use the system to (i) find targets of active molecules that have been identified in whole cell screenings; (ii) identify mycobacterial proteins that activate or deactivate drugs; (iii) establish simple assays for proteins previously identified as key targets. Since the identification of protein targets of a small molecule drug is challenging, improved methods are asked that facilitate their discovery. With the recent development of an optimised yeast three-hybrid system in the Johnsson group, the stage is set for its application to identify small molecule-protein interactions. This adapted version of the classical yeast two-hybrid system features an additional third synthetic hybrid ligand. It uses SNAP-tag (a self-labelling protein tag) as an anchor protein and O6-benzylguanine (BG) derivatives as synthetic ligands. Currently it allows the screening of human cDNA libraries for small molecule-protein interactions in yeast. To apply this system for drug discovery against tuberculosis, the construction of genomic libraries of M. smegmatis was initiated and libraries of M. tuberculosis will follow. We would start with conjugating known TB drugs (with known or unknown targets) to BG and screen them against genomic libraries. Suggested drugs to start are rifampicin and BTZ as positive controls and clofazimine and thiocarlide as drugs with unclear mechanism of action. Noteworthy that the three-hybrid screen can also be applied for the identification of proteins that activate a certain drug. Furthermore, once a protein-ligand is identified, the hybrid assay can be used to screen for new drugs against this target in HTS compatible competition assay.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Pharmakologie und Pharmazie Arzneimittelforschung
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Pneumologie Tuberkulose
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP7-PEOPLE-2009-IEF
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
1015 LAUSANNE
Schweiz
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.