Objectif
Double-strand breaks (DSBs) occur frequently in the genome by DNA damaging agents or during genome replication. DSBs are hazardous because interaction between DNA ends from different double strand breaks can produce tumorigenic chromosome translocations. Little is known about how repair factors function in the context of chromatin and how translocations form in vivo. I developed a cell system in which a DSB can specifically be induced at a defined genomic site and follow the fate of damaged DNA in living cells. Using this system, I showed but that the broken ends are positionally stable and unable to roam the cell nucleus and I identified that the repair factor Ku80 is required for maintaining the alignment of broken ends. I extended the use of this system to probe how DSBs are recognized in vivo and how DDR pathways are triggered in the context of chromatin. I found that tethering a single component of a DSB repair complex to chromatin is sufficient to elicit the DDR in the absence of DNA damage and that stable association of the mediator of DDR MDC1 induces high local chromatin decondensation. I will use a combination of advanced live cell imaging and biochemistry techniques to further test the importance of nuclear architecture in maintaining genomic integrity and I will identify novel factors involved in DSB repair and alignment of broken chromosomes. More specifically I plan to: 1. Visualize the formation of chromosome translocations in vivo and determine the role of chromatin structure and nuclear organization in the process using time-lapse imaging. 2. Investigate the role of the repair factor MDC1 in chromatin decondensation using yeast two hybrid and advanced biochemistry in mammalian cells. 3. Identify novel proteins that accumulate in DSBs using biochemical fractionation and purification methods. 4. Identify novel proteins that align broken chromosome ends by high-through-put siRNA screening.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-RG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
67404 Illkirch Graffenstaden
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.