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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-18

Molecular analysis of the mechanisms linking co-transcriptional splicing with chromatin

Objetivo

"The project will exploit recent work in Arabidopsis (in the Dean laboratory) linking RNA metabolism and chromatin silencing (Liu et al 2009). The Dean group is focused on RNA-mediated chromatin regulation of an important repressor of flowering called FLOWERING LOCUS C (FLC). The concepts that have emerged from this study have wide relevance in many organisms. Conserved RNA 3’ processing factors function with an RNA-binding protein to target polyadenylation to a specific site in the FLC antisense transcript. This 3’ processing event triggers histone demethylation and transcriptional silencing of the locus. Their unpublished work shows that a conserved splicing factor, specifically PRP8, a core component of the spliceosome, also functions in this mechanism. The overall aim of the proposal is to reveal the molecular mechanism of involvement of splicing factor PRP8 on anti-sense RNA dependent regulation of transcription of FLC in Arabidopsis and to test generality of that mechanism on other anti-sense regulated genes.

The specific objectives of the proposal include:
1.Fully characterizing the FLC antisense transcript changes in the splicing factor mutant (prp8) mutant.
2.Analysing the contributions of RNA degradation pathways in the accumulation of FLC antisense transcripts in wild type and in prp8 mutant backgrounds.
3.Analysing the interactions between splicing and 3’ processing of the antisense transcripts.
4.Generating and analysing directed mutations in PRP8 to explore whether the prp8 allele generated in the forward mutant screen is hypomorphic or has lost a specific function but is still wild-type for generic splicing functions.
5.Analysing the components of the RNP complex that are assembled on the antisense transcript.

A better understanding of the flowering control of the agricultural crops is fully in line with goals of research in the FP7 first priority thematic areas, such as Food, Agriculture and Biotechnology and Environment including climate changes."

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2010-IEF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinador

JOHN INNES CENTRE
Aportación de la UE
€ 281 680,00
Dirección
NORWICH RESEARCH PARK COLNEY
NR4 7UH NORWICH
Reino Unido

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Región
East of England East Anglia Breckland and South Norfolk
Tipo de actividad
Research Organisations
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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