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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Exploring natural variation of Shade Avoidance Syndrome in Arabidopsis using high-throughput phenotyping and Genome-wide association studies

Objectif

"Higher plants respond to a change in light quality -indicative of competition from other plants- by eliciting a range of adaptations summarized under the term Shade Avoidance Syndrome (SAS). These action responses include e.g. increased elongation of organs (e.g. hypocotyls, stems), a decrease in leaf surface, a more erect leaf position, rapid changes in gene expression and an accelerated transition to flowering. Our molecular understanding of SAS mostly comes from studies in Arabidopsis thaliana but numerous questions remain unanswered. Most SAS studies were performed in young seedlings but the role of many SAS regulators in more adult plants remains poorly characterized. In order to extent our understanding of SAS the following issues are addressed in the proposed project:
(i) SAS traits will be measured (phenotyped) on rosette stage plants using a custom built high-throughput phenotyping device (Scanalyzer HTS) as well as in young seedlings.
(ii) The SAS includes a number of physiological adaptations in different organs and different growth stages. To determine the extent to which regulators of the SAS are involved in shade avoidance we will phenotype selected mutants with a defective response to shade such as pif4, pif5, and sav3.
(iii) It has been proposed that PIF4/PIF5 and SAV3 act in different pathways. To test this hypothesis we will phenotype pif4, pif5, sav3 and associated double/triple mutants.
(iv) Natural variation in shade avoidance will be assessed by phenotyping a collection of field-collected Arabidopsis accessions
(v) SAS traits measured in those accessions will further be exploited by a Genome-wide association (GWA) study to identify genetic loci that control SAS and may underlie adaptation to their local environment. In consequence, the GWA could lead to unravel the function of known and novel regulators of SAS, which in turn should contribute to a better understanding of the SAS regulatory network in different organs and developmental stages."

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2010-IEF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinateur

UNIVERSITE DE LAUSANNE
Contribution de l’UE
€ 185 528,80
Adresse
QUARTIER UNIL CENTRE - BATIMENT UNICENTRE
1015 LAUSANNE
Suisse

Voir sur la carte

Région
Schweiz/Suisse/Svizzera Région lémanique Vaud
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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