Objectif
"Accurate pre-mRNA splicing is a fundamental step for gene expression. SR proteins, a protein family of splicing regulators, play an essential role in the process by defining intron-exon boundaries and recruiting the spliceosome to carry out splicing. Pre-mRNA splicing occurs co-transcriptionally and it is now emerging that promoter identity modulates alternative splicing, possibly through the recruitment of SR proteins or through kinetic coupling by altering Pol II elongation rates. The aim of the present proposal is to investigate the relationship between promoter elements, differential SR protein recruitment to genes and splicing outcome.
The genome-wide recruitment of SR proteins to promoter elements will be investigated resorting to innovative approaches. SR proteins tagged with LAP-tag and expressed in ""BAC cell lines"" will be isolated with associated DNA sequences (ChIP) which will then be used to interrogate a genome-wide promoter microarray (ChIP-on-CHIP). This will reveal similarities and differences in recruitment to genes and gene regions among SR protein family. To test how promoter elements influence spliceosome assembly and splicing outcome, model-genes containing alternative and constitutively spliced exons will be created. The focus will be on genes relevant for neuronal differentiation. Model genes will be introduced in cells already expressing individual SR proteins BACs, creating ""Double-BAC cell lines"". The results expected from this project will provide a global view of SR protein role in regulating and coupling transcription and pre-mRNA splicing. Elucidating these regulatory mechanisms is key for the understanding of genomic and proteomic diversity."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2010-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
80539 Munchen
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.