Objectif
Recently both academic institutions and the pharmaceutical industry have identified 3 dimensional (3D) cellular model systems as one of the most important areas of future development in drug discovery programs and cell-based screening. High-content screening (HCS) platforms with large-scale automation and data analysis are extensively used in such programs. Automated image processing is a critical and rate-limiting step in HCS workflows that can be resolved by computational approaches. However, this has currently only been approached in a 2D manner and would benefit hugely from the ability to extend into 3D analyses.
I plan to develop a 3D image processing-statistical framework with emphasis on 3D segmentation that can be highly useful for numerous researchers working in biomedical and molecular biological fields. This project is based on my previous expertise in developing a high-content analysis pipeline around 2D image segmentation. Any current areas of research that use traditional microscopic high-throughput analyses have the potential to benefit from this tool. These include microscopic model organisms and mammalian cell research. This software will not be limited to fluorescence microscopy, but can also be applied to other platforms such as electron microscopy and in vivo imaging of animals. I will expand and characterize the means by which 3D image segmentation enables the analysis of these models in large-scale.
Continuing my previous research, one interesting application is the study of autophagy in MCF-10A mammary epithelial cells that is an easy and tractable 3D model system used in drug screening for the pathogenesis of epithelial tumours.
In summary, the development of 3D imaging tools will move the field of high-content analysis forward and open a new dimension to HCS methodologies that I hope will find its way into standard protocols. The successful completion of this project will enable me to become a leading expert in this field within Europe.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie découverte de médicaments
- sciences naturelles informatique et science de l'information science des données
- sciences naturelles informatique et science de l'information logiciel
- sciences sociales sociologie relations industrielles automatisation
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie electron microscopy
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2010-RG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
W1B 1AL LONDON
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.