Ziel
Recently both academic institutions and the pharmaceutical industry have identified 3 dimensional (3D) cellular model systems as one of the most important areas of future development in drug discovery programs and cell-based screening. High-content screening (HCS) platforms with large-scale automation and data analysis are extensively used in such programs. Automated image processing is a critical and rate-limiting step in HCS workflows that can be resolved by computational approaches. However, this has currently only been approached in a 2D manner and would benefit hugely from the ability to extend into 3D analyses.
I plan to develop a 3D image processing-statistical framework with emphasis on 3D segmentation that can be highly useful for numerous researchers working in biomedical and molecular biological fields. This project is based on my previous expertise in developing a high-content analysis pipeline around 2D image segmentation. Any current areas of research that use traditional microscopic high-throughput analyses have the potential to benefit from this tool. These include microscopic model organisms and mammalian cell research. This software will not be limited to fluorescence microscopy, but can also be applied to other platforms such as electron microscopy and in vivo imaging of animals. I will expand and characterize the means by which 3D image segmentation enables the analysis of these models in large-scale.
Continuing my previous research, one interesting application is the study of autophagy in MCF-10A mammary epithelial cells that is an easy and tractable 3D model system used in drug screening for the pathogenesis of epithelial tumours.
In summary, the development of 3D imaging tools will move the field of high-content analysis forward and open a new dimension to HCS methodologies that I hope will find its way into standard protocols. The successful completion of this project will enable me to become a leading expert in this field within Europe.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Grundlagenmedizin Pharmakologie und Pharmazie Arzneimittelforschung
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
FP7-PEOPLE-2010-RG
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
W1B 1AL LONDON
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.