Objectif
Today the vast amount of newly published genomic data is generated by metagenomic projects. The annotation of these sequences of organisms, whose existence was not even known before their DNA was extracted from environmental samples, has led to the identification of thousands of new protein families with no detectable homology to any proteins in sequenced and cultivable organisms. While these protein families now make up a major part of the protein universe, we do not know anything about their functions or biocatalytic activity. In this grant application, we propose to lay the groundwork for studying the function of this vast set of proteins and exploit their biocatalytic potential. However, many of the techniques traditionally used to elucidate protein function, such as genetics and “omics”-technologies are not applicable, because the organisms in which these proteins exist are as of yet unknown. Therefore we plan to:
1. Computationally analyze the newly discovered protein families to identify one paradigmatic member of every novel family.
2. Create an expression-plasmid library of those paradigmatic representatives by de novo gene-synthesis.
3. Use this library, combined with the power of Escherichia coli genetics, for specific complementation studies and biochemical assays to assign functions to novel protein families.
This combination of synthetic biology and metagenomics will provide the starting point for a novel systematic approach to harness the biocatalytic potential and to understand the function of an unknown sector of biology that has only very recently been discovered.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie synthétique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2011-StG_20101109
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
44801 Bochum
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.