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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-16

Computational toolbox for protein surface docking

Objetivo

Recent combinatorial biotechnologies have shown that the molecular recognition capability of proteins can be specifically oriented toward inorganic surfaces. The use of technologies based on such specificity would give European industry a competitive edge in several emerging fields (from nanoelectronics over biomaterials science to drug design), spanning different thematic areas of FP6.

However, at present the principles regulating protein-surface interactions are poorly understood, thus hindering such technologies from taking off.

What features of the surface and of the proteins (electronic, structural, morphological) determine which protein is able to bind to a given surface and how?

PROSURF will answer this question and provide the European scientific/technological community with computational tools to enable rational design of protein-surface associations.

As automated in silico docking revolutionized the process of drug discovery, so the outcomes of PROSURF will open genuinely new routes to solve several urgent technological problems, such as self-assembly of nanoelectronic devices or design of highly biocompatible materials. PROSURF is risky because it addresses a largely unexplored subject; however, the risk is compensated by the potential of enormous impact.

Our strategy to probe the determinants of protein-surface specificity, and to implement the envisaged computational tools, integrates state-of-the-art computational techniques and experiments. It consists of a series of computational steps, including quantum-mechanics based parameterisation of protein-surface interactions, molecular dynamics simulation of proteins on surfaces, and the implementation of protein-surface docking software, corroborated by tailored experiments.

Although the project focus is on theory, feedback from experiments will be important both to validate the computational tools, and to gain new insight into the basis of protein-surface interactions.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2004-NEST-C-1
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinador

UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI MODENA E REGGIO EMILIA
Aportación de la UE
Sin datos
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos

Participantes (4)

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