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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS
Contenu archivé le 2024-06-16

Computational toolbox for protein surface docking

Objectif

Recent combinatorial biotechnologies have shown that the molecular recognition capability of proteins can be specifically oriented toward inorganic surfaces. The use of technologies based on such specificity would give European industry a competitive edge in several emerging fields (from nanoelectronics over biomaterials science to drug design), spanning different thematic areas of FP6.

However, at present the principles regulating protein-surface interactions are poorly understood, thus hindering such technologies from taking off.

What features of the surface and of the proteins (electronic, structural, morphological) determine which protein is able to bind to a given surface and how?

PROSURF will answer this question and provide the European scientific/technological community with computational tools to enable rational design of protein-surface associations.

As automated in silico docking revolutionized the process of drug discovery, so the outcomes of PROSURF will open genuinely new routes to solve several urgent technological problems, such as self-assembly of nanoelectronic devices or design of highly biocompatible materials. PROSURF is risky because it addresses a largely unexplored subject; however, the risk is compensated by the potential of enormous impact.

Our strategy to probe the determinants of protein-surface specificity, and to implement the envisaged computational tools, integrates state-of-the-art computational techniques and experiments. It consists of a series of computational steps, including quantum-mechanics based parameterisation of protein-surface interactions, molecular dynamics simulation of proteins on surfaces, and the implementation of protein-surface docking software, corroborated by tailored experiments.

Although the project focus is on theory, feedback from experiments will be important both to validate the computational tools, and to gain new insight into the basis of protein-surface interactions.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP6-2004-NEST-C-1
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinateur

UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI MODENA E REGGIO EMILIA
Contribution de l’UE
Aucune donnée
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée

Participants (4)

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