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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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Contenuto archiviato il 2024-06-16

Computational toolbox for protein surface docking

Obiettivo

Recent combinatorial biotechnologies have shown that the molecular recognition capability of proteins can be specifically oriented toward inorganic surfaces. The use of technologies based on such specificity would give European industry a competitive edge in several emerging fields (from nanoelectronics over biomaterials science to drug design), spanning different thematic areas of FP6.

However, at present the principles regulating protein-surface interactions are poorly understood, thus hindering such technologies from taking off.

What features of the surface and of the proteins (electronic, structural, morphological) determine which protein is able to bind to a given surface and how?

PROSURF will answer this question and provide the European scientific/technological community with computational tools to enable rational design of protein-surface associations.

As automated in silico docking revolutionized the process of drug discovery, so the outcomes of PROSURF will open genuinely new routes to solve several urgent technological problems, such as self-assembly of nanoelectronic devices or design of highly biocompatible materials. PROSURF is risky because it addresses a largely unexplored subject; however, the risk is compensated by the potential of enormous impact.

Our strategy to probe the determinants of protein-surface specificity, and to implement the envisaged computational tools, integrates state-of-the-art computational techniques and experiments. It consists of a series of computational steps, including quantum-mechanics based parameterisation of protein-surface interactions, molecular dynamics simulation of proteins on surfaces, and the implementation of protein-surface docking software, corroborated by tailored experiments.

Although the project focus is on theory, feedback from experiments will be important both to validate the computational tools, and to gain new insight into the basis of protein-surface interactions.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2004-NEST-C-1
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

STREP - Specific Targeted Research Project

Coordinatore

UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI MODENA E REGGIO EMILIA
Contributo UE
Nessun dato
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (4)

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