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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

A combined approach of cryo-electron tomography and protein tagging for elucidating the structural organization of the human Nuclear Pore Complex

Ziel

Nuclear Pore Complexes (NPCs) represent the exclusive passageway in and out of the nucleus but also function in gene regulation and nuclear organization. NPCs serve as docking sites for many viruses and were associated with several human diseases, e.g. leukemia. Understanding the nuclear transport mechanism will have a huge impact on human health research of such diseases. Multiple copies of ~30 different protein components, termed nucleoporins (Nups), form the major building blocks of NPC. Nups are organized as repetitive modules, called subcomplexes. The subcomplexes, in turn, form the scaffold of NPC in an unknown arrangement. Despite their importance, structure determination of NPCs is a considerable challenge, primarily due to their sheer size.

To generate an atomic model of the human NPC, data at the different resolution levels have to be systematically collected and integrated. Determining the position of Nup subcomplexes within the NPC will be a critical step to bridge the resolution gap between different structural techniques. Since the precision of 2D-immuno-gold labeling techniques is insufficient to associate individual Nups with distinct features of the NPC structure from cryo-electron tomography (cryo-ET), alternative strategies are needed to achieve this goal. Here I propose to improve the resolution of the human NPC structure to allow assigning subcomplexes into the overall assembly. This will be achieved by cryo-ET, subtomogram averaging and further development of algorithms correcting for NPC plasticity. Furthermore, I will determine the precise positioning of subcomplexes by obtaining 3D structures of NPCs containing tagged Nups. This will contribute significantly to our understanding of the overall organization of the NPC and thus, nuclear tranport mechanism. This proposed project will give me the opportunity to learn new skills, acquire competencies and, thus pave the way towards an independent career.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP7-PEOPLE-2011-IEF
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Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Koordinator

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
EU-Beitrag
€ 174 475,20
Adresse
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Deutschland

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Region
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

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