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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Mechanisms underlying epigenetic regulation by small non-coding RNAs

Objectif

For a long time it has been accepted that a big part of the genome consisted of the so-called ''junk'' DNA without functional importance. Through the ENCODE project it has been evident that the vast majority of this DNA is in fact transcribed into RNA, producing a huge number of small and long non-coding RNAs (ncRNAs) of unknown function. Previous studies suggested that ncRNAs may be implicated among others in epigenetic regulation. Aim of the current project is to investigate the mechanisms underlying this form of regulation with regards to gene silencing by Polycomb Repression Complex 2 (PRC2) and establishment of specific chromatin marks like H4K12 acetylation. As a model system we employ mouse pluripotent stem cells during differentiation and reprogramming, which are characterized by remarkable chromatin remodelling offering the possibility to track chromatin dynamics in relation with changes in ncRNAs. We will apply RIP-seq for PRC2 to identify small ncRNAs associated with action of this complex and test how they are connected with silencing of selected genomic regions in our model system. To this end, we want to identify the mechanisms through which these ncRNAs guide PRC2. In addition, we want to develop a high throughput approach to map genome wide at the chromatin level small ncRNAs associated with selected histone modifications like H4K12 acetylation and check their distribution around critical genomic elements like promoters and splice junctions. Deliverables of this project will provide an unprecedented insight into the way chromatin modifications and complexes are involved in epigenetic regulation via ncRNAs. This project combines the field of epigenetics with the emerging field of ncRNAs. It will enable the applicant to interact with a lab in Harvard which is world leader in the field of ncRNAs and a lab in ETH Zurich which is driving force in epigenetics, thus creating interesting synergies between the two research environments towards RNAepigenetics.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2011-IOF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IOF - International Outgoing Fellowships (IOF)

Coordinateur

EIDGENOESSISCHE TECHNISCHE HOCHSCHULE ZUERICH
Contribution de l’UE
€ 275 362,50
Adresse
Raemistrasse 101
8092 Zuerich
Suisse

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Région
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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