Obiettivo
For a long time it has been accepted that a big part of the genome consisted of the so-called ''junk'' DNA without functional importance. Through the ENCODE project it has been evident that the vast majority of this DNA is in fact transcribed into RNA, producing a huge number of small and long non-coding RNAs (ncRNAs) of unknown function. Previous studies suggested that ncRNAs may be implicated among others in epigenetic regulation. Aim of the current project is to investigate the mechanisms underlying this form of regulation with regards to gene silencing by Polycomb Repression Complex 2 (PRC2) and establishment of specific chromatin marks like H4K12 acetylation. As a model system we employ mouse pluripotent stem cells during differentiation and reprogramming, which are characterized by remarkable chromatin remodelling offering the possibility to track chromatin dynamics in relation with changes in ncRNAs. We will apply RIP-seq for PRC2 to identify small ncRNAs associated with action of this complex and test how they are connected with silencing of selected genomic regions in our model system. To this end, we want to identify the mechanisms through which these ncRNAs guide PRC2. In addition, we want to develop a high throughput approach to map genome wide at the chromatin level small ncRNAs associated with selected histone modifications like H4K12 acetylation and check their distribution around critical genomic elements like promoters and splice junctions. Deliverables of this project will provide an unprecedented insight into the way chromatin modifications and complexes are involved in epigenetic regulation via ncRNAs. This project combines the field of epigenetics with the emerging field of ncRNAs. It will enable the applicant to interact with a lab in Harvard which is world leader in the field of ncRNAs and a lab in ETH Zurich which is driving force in epigenetics, thus creating interesting synergies between the two research environments towards RNAepigenetics.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze mediche e della salute biotecnologia medica tecnologie cellulari cellule staminali
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze naturali scienze biologiche genetica epigenetica
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IOF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
8092 Zuerich
Svizzera
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.