Objectif
In this proposal, Dr. Ruthstein and her new group at the chemistry department in Bar-Ilan University, Israel, will determine the sensing and transcription mechanisms of metal ion sensors in bacteria. Metals are commonly found as natural constituents of proteins; however, many metal ions can be toxic when free in biological fluids. Hence, microorganisms have evolved considerable regulatory machinery to control the intracellular and extracellular concentrations and types of metal ions encountered in their microenvironments. Gene regulatory proteins, called metal sensor proteins mediate this metal traffic control. These proteins have evolved metal coordination sites that “sense” specific metal ion and activate or inhibit DNA binding or transcription activation, thereby controlling the expression of genes that mediate what must be an exquisitely selective adaptive response. In order to understand how the sensor senses a specific metal and by this initiates a biological process, one has to be able to probe strutuctural changes that occur in the protein as a function of binding of the correct and wrong metal ion, and the binding of the DNA. This work will use site-directed spin labeling together with pulsed electron paramagnetic resonance spectroscopy (EPR) to shed light on such processes. EPR is an excellent tool to resolve systems that evolve protein-protein interaction and protein-DNA interaction. Distances up to 80 Å between two paramagnetic spin labels can be measured by pulsed EPR. In some cases, the measurement of one distance (or a few) is sufficient to establish the plausibility of a mechanism or corroborate a proposed structure. This work will initially focus on two Cu+ sensors (CsoR, CueR) from CsoR and MerR families. The first family inhibits DNA binding upon metal binding and the second activates transcription, but the research will extend in the future to other metal sensors from each of the families.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2011-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
52900 Ramat Gan
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.