Objectif
The rice blast fungus M. oryzae has emerged as a paradigm for the understanding of fungal aerial attack. M. oryzae also infect roots. Consequently, M. oryzae-rice interaction represents an excellent pathosystem for comparative studies of the distinct organ-specific mechanisms that occur during fungal colonisation of rice leaves and roots. We have characterised two pathogenicity-deficient mutants in M. oryzae lacking the karyopherin Msn5p/EXP5 [Plant Cell 22, 953 (2010)] and a novel RNA-binding protein (RBP35) present exclusively in filamentous fungi [PLoS Pathogens, under review]. This project aims to investigate both organ-specific and pos-transcriptional mechanisms that regulate the ability of M. oryzae to infect rice using the resources generated previously in my group. The work outlined in this proposal will extend this area of research through:
1. Deep sequencing experiments using infected rice leaves and roots with a wild-type M. oryzae strain to follow changes in gene expression in the fungus and in the host plant.
2. Tandem affinity purification experiments using EXP5-tagged with HA-FLAG to identify proteins and RNAs that directly interact with EXP5.
3. Tandem affinity purification experiments using highly conserved proteins of the M. oryzae polyadenylation machinery to identify additional protein components and use a combination of SELEX and bioinformatic approaches to discover alternative polyadenylation signals in M. oryzae genes.
4. In vivo visualisation of infection-related mRNAs including fungal effectors using the lambdaN/GFP system to analyse the involvement of RBP35 in mRNA transport and/or localisation.
At present there is a lack of knowledge of the EXP5 cargoes in filamentous fungi and very little is known about the post-transcriptional mechanisms that regulate fungal plant infection. Further, this research will open exciting avenues about local control of translation of proteins significant for M. oryzae plant invasion (fungal effectors).
Champ scientifique (EuroSciVoc)
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP7-PEOPLE-2011-CIG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
28040 MADRID
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.