Objetivo
Since biology is by and large a 3-dimensional phenomenon, 3D imaging has a significant impact on many challenges in life sciences. 3D matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) imaging mass spectrometry (IMS) is an emerging label-free 3D imaging technology with high potential in proteomics and metabolomics. 3D MALDI-IMS is based on 2D MALDI-IMS, which in the last years has proven its value in metabolomics, glycomics, lipidomics, peptidomics, and proteomics. However, 3D MALDI-IMS cannot tap its full potential due to the lack of computational methods for processing large and complex 3D IMS data. Our main goal is to realise 3D label-free proteomics and metabolomics by providing new statistical methods for the reproducible collection of 3D MALDI-IMS data, and for un- and supervised statistical analysis and interpretation of this data. We will validate our methods in diabetes research, surgical metabolomics, and natural products research. To reach our global goal, we will develop methodologies for reproducible collection of 3D MALDI-IMS data, develop a statistical simulator of MALDI-IMS data and evaluation strategies for statistical methods, develop preprocessing, unsupervised, and supervised methods of statistical analysis of 3D MALDI-IMS data, evaluate the developed methods on simulated and real-life proteomics and metabolomics data, and implement them using efficient graphic processing unit (GPU) architecture. This project is of high importance for research-intensive SME partners, Denator and SagivTech, since it would create a new market segment for them. Expertise of partners in biomedicine and their strong connections to clinical partners ensure adoption of the new methods into clinical practice. The developed methods and protocols can be potentially used in any biomedical application where 3D MALDI-IMS is advantageous such as cancer and diabetes diagnostics, disease pathway elucidation, histopathology, and discovery of biomarkers or antibiotics.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica endocrinología diabetes
- ciencias naturales informática y ciencias de la información ciencias de la computación
- ciencias naturales ciencias químicas química analítica espectrometría de masas
- ciencias naturales ciencias físicas óptica física del láser
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-HEALTH-2012-INNOVATION-1
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
69117 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.