Objetivo High-throughput sequencing (HTS) is a powerful and rapidly evolving family of technologies with a multitude of applications. They include genetics of rare and common diseases, understanding of disease mechanism and progression through transcriptome and epigenome profiling, cancer stratification, personalised medicine and molecular systems biology of gene regulation. The genome, epigenome, transcriptome and interactome are all intricately connected, and modern HTS technology can probe all of these -omic levels. Statistical analysis is a crucial component of many experiments and studies, and the quality and efficiency of the analysis often determines the success of a project.In this collaborative project we will develop a range of new statistical analysis tools to solve open problems in HTS data analysis, ranging from low-level processing of sequence reads up to systems-level modelling of disease associated and cellular processes. We will provide to a wide audience an integrated computational framework for HTS data analysis and interpretation that is robust, efficient and user-friendly. We will establish improved procedures for the publishing of statistical software as an integral part of the scientific publication process, within the framework of the Bioconductor project. We will provide tools to benchmark experimental protocols and statistical methods, and we will provide training materials and a extensive training programme to rapidly disseminate these new tools to the broader biomedical community.SME partners will integrate these new tools within their analysis pipelines with associated user-friendly commercial software providing access to their additional proprietary tools. SMEs will benefit from basic methodology development done in a public, pre-competitive arena and will be able to use these technologies to enhance their products and services. Ámbito científico ciencias naturalesinformática y ciencias de la informaciónciencia de datosciencias naturalesinformática y ciencias de la informaciónsoftwareciencias médicas y de la saludmedicina clínicaoncologíaciencias médicas y de la saludciencias de la saludmedicina personalizadaciencias naturalesciencias biológicasgenéticagenoma Programa(s) FP7-HEALTH - Specific Programme "Cooperation": Health Tema(s) HEALTH.2012.2.1.1-3 - Statistical methods for collection and analysis of -omics data Convocatoria de propuestas FP7-HEALTH-2012-INNOVATION-1 Consulte otros proyectos de esta convocatoria Régimen de financiación CP-FP - Small or medium-scale focused research project Coordinador THE UNIVERSITY OF MANCHESTER Dirección Oxford road M13 9PL Manchester Reino Unido Ver en el mapa Región North West (England) Greater Manchester Manchester Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Contacto administrativo Katherine Boylan (Dr.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window Aportación de la UE € 635 452,00 Participantes (9) Ordenar alfabéticamente Ordenar por aportación de la UE Ampliar todo Contraer todo Genomatix Software GmbH Alemania Aportación de la UE € 439 000,00 Dirección Bayerstrasse 85a 80335 Muenchen Ver en el mapa Región Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt Tipo de actividad Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contacto administrativo Korbinian Grote (Dr.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window GENOMNIA SRL Italia Aportación de la UE € 306 059,60 Dirección Corso magenta 56 20123 Milano Ver en el mapa Región Nord-Ovest Lombardia Milano Tipo de actividad Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments) Contacto administrativo Cinzia Ferraro (Mrs.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY Alemania Aportación de la UE € 531 472,20 Dirección Meyerhofstrasse 1 69117 Heidelberg Ver en el mapa Región Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis Tipo de actividad Research Organisations Contacto administrativo Virginia Otón García (Ms.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window FONDAZIONE TELETHON ETS Italia Aportación de la UE € 187 500,00 Dirección Via varese 16/b 00185 Roma Ver en el mapa Región Centro (IT) Lazio Roma Tipo de actividad Research Organisations Contacto administrativo Irene Mearelli (Mrs.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window FONDAZIONE ISTITUTO ITALIANO DI TECNOLOGIA Italia Aportación de la UE € 256 862,40 Dirección Via morego 30 16163 Genova Ver en el mapa Región Nord-Ovest Liguria Genova Tipo de actividad Research Organisations Contacto administrativo Alessandra Gastaldi (Ms.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window ASSOCIATION POUR LA RECHERCHE ET LE DEVELOPPEMENT DES METHODES ET PROCESSUS INDUSTRIELS Francia Aportación de la UE € 315 428,00 Dirección Boulevard saint michel 60 75272 Paris Ver en el mapa Región Ile-de-France Ile-de-France Paris Tipo de actividad Research Organisations Contacto administrativo Florence Thépenier (Mrs.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window University of Zurich Suiza Aportación de la UE € 356 758,00 Dirección Ramistrasse 71 8006 Zurich Ver en el mapa Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Contacto administrativo Mark Robinson (Prof.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE Reino Unido Aportación de la UE € 268 776,00 Dirección Trinity lane the old schools CB2 1TN Cambridge Ver en el mapa Región East of England East Anglia Cambridgeshire CC Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Contacto administrativo Renata Shaeffer (Ms.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window THE UNIVERSITY OF SHEFFIELD Reino Unido Aportación de la UE € 374 941,20 Dirección Firth court western bank S10 2TN Sheffield Ver en el mapa Región Yorkshire and the Humber South Yorkshire Sheffield Tipo de actividad Higher or Secondary Education Establishments Contacto administrativo Joanne Watson (Ms.) Enlaces Contactar con la organización Opens in new window Sitio web Opens in new window