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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

Rapid development and distribution of statistical tools for high-throughput sequencing data

Ziel

High-throughput sequencing (HTS) is a powerful and rapidly evolving family of technologies with a multitude of applications. They include genetics of rare and common diseases, understanding of disease mechanism and progression through transcriptome and epigenome profiling, cancer stratification, personalised medicine and molecular systems biology of gene regulation. The genome, epigenome, transcriptome and interactome are all intricately connected, and modern HTS technology can probe all of these -omic levels. Statistical analysis is a crucial component of many experiments and studies, and the quality and efficiency of the analysis often determines the success of a project.

In this collaborative project we will develop a range of new statistical analysis tools to solve open problems in HTS data analysis, ranging from low-level processing of sequence reads up to systems-level modelling of disease associated and cellular processes. We will provide to a wide audience an integrated computational framework for HTS data analysis and interpretation that is robust, efficient and user-friendly. We will establish improved procedures for the publishing of statistical software as an integral part of the scientific publication process, within the framework of the Bioconductor project. We will provide tools to benchmark experimental protocols and statistical methods, and we will provide training materials and a extensive training programme to rapidly disseminate these new tools to the broader biomedical community.

SME partners will integrate these new tools within their analysis pipelines with associated user-friendly commercial software providing access to their additional proprietary tools. SMEs will benefit from basic methodology development done in a public, pre-competitive arena and will be able to use these technologies to enhance their products and services.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP7-HEALTH-2012-INNOVATION-1
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

CP-FP - Small or medium-scale focused research project

Koordinator

THE UNIVERSITY OF MANCHESTER
EU-Beitrag
€ 635 452,00
Adresse
OXFORD ROAD
M13 9PL Manchester
Vereinigtes Königreich

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Region
North West (England) Greater Manchester Manchester
Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (9)

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