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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-20

High throughput proteomics using accurate mass and time tags

Objetivo

The environment of a given organism determines the dynamics of gene expression, post-translational modifications of proteins and their interactions. Proteomics and genomics approaches now allow capturing these dynamics, which govern the life of an organism. Proteomics is devoted to the systematic study of proteins in order to derive a global perspective of the structures, functions and regulatory mechanisms in biological systems. The proteome represents the entire protein complement of a cell or a tissue a t a given time, in given environmental, physiological and/or pathological conditions. The dynamic nature of the proteome constitutes one of the major hurdles of proteomics analyses. Whereas the analysis of a single sample can potentially provide all the genetic information about an organism, a multitude of analyses in various conditions are necessary for proteome studies. Recent years have seen an intensive development in proteomics methodologies.

Among these, accurate mass and time (AMT) tag based proteomic is particularly promising to provide extensive proteome coverage with high throughput. An AMT tag database is established by using standard proteomics methods to identify peptides and their parent proteins. Identifications are then validated using accurate masses obtained by Fourier Transform Mass Spectrometry (FTMS) and Liquid Chromatography (LC) retention times. The AMT tag database obviates the need for MS/MS in all subsequent analyses, providing the basis for throughput improvements. We are getting involved in a large-scale effort to implement and develop AMT-tag based methods.

Our strategy includes new technological developments and biological applications. We plan to improve the method's quantitative ability, and to promote the use of alternative ion dissociation methods to study post-translational modifications. Initial applications include studies of the membrane from A. thaliana chloroplasts and of a mouse model of the graft vs host disease.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2004-MOBILITY-12
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

IRG - Marie Curie actions-International re-integration grants

Coordinador

COMMISSARIAT L'ENERGIE ATOMIQUE
Aportación de la UE
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Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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