Objetivo
The production of proteins in bacteria is largely controlled by the regulation of gene transcription, via the binding of protein "transcription factors" to the DNA. This network of regulatory interactions allows the bacterium to control its internal processes and interact with the environment in a sophisticated way. The production and degradation of transcription factors is, however, strongly affected by the cell cycle. During the cell cycle, the DNA in the cell is copied and the cell volume doubles, before the cell divides in two. Although these events must have important and striking consequences for the performance of bacterial gene networks, these effects have hardly been addressed either theoretically or experimentally.
In this project, a combined simulation and experimental approach is proposed, to investigate the effect of the cell cycle on gene networks in the bacterium Escherichia coli. We will use advanced simulation techniques, including a method developed by me during my Marie Curie Fellowship, to predict the growth-rate dependence of the performance of two simple, representative gene circuits: an auto-repressor loop and a bistable switch. In parallel, experiments will be carried out to incorporate already existing gene circuits onto the chromosome of E. coli, in order to measure their behaviour for different bacterial growth rates. For the auto-repressor, the output will be the average repressor concentration and the variation among cells in a genetically identical population; for the switch, it will be the spontaneous flipping rate. The results will be compared directly to simulation predictions.
The project aims at a quantitative understanding of the performance of gene networks, for cells in "real-life" situations of growth and division. We seek to bridge the gap between the current simple models and naturally occurring gene networks. Integration of high-level theoretical work with experiments makes this a very exciting proposal.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales matemáticas matemáticas aplicadas modelo matemático
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2004-MOBILITY-11
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
EDINBURGH
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.