Ziel
The production of proteins in bacteria is largely controlled by the regulation of gene transcription, via the binding of protein "transcription factors" to the DNA. This network of regulatory interactions allows the bacterium to control its internal processes and interact with the environment in a sophisticated way. The production and degradation of transcription factors is, however, strongly affected by the cell cycle. During the cell cycle, the DNA in the cell is copied and the cell volume doubles, before the cell divides in two. Although these events must have important and striking consequences for the performance of bacterial gene networks, these effects have hardly been addressed either theoretically or experimentally.
In this project, a combined simulation and experimental approach is proposed, to investigate the effect of the cell cycle on gene networks in the bacterium Escherichia coli. We will use advanced simulation techniques, including a method developed by me during my Marie Curie Fellowship, to predict the growth-rate dependence of the performance of two simple, representative gene circuits: an auto-repressor loop and a bistable switch. In parallel, experiments will be carried out to incorporate already existing gene circuits onto the chromosome of E. coli, in order to measure their behaviour for different bacterial growth rates. For the auto-repressor, the output will be the average repressor concentration and the variation among cells in a genetically identical population; for the switch, it will be the spontaneous flipping rate. The results will be compared directly to simulation predictions.
The project aims at a quantitative understanding of the performance of gene networks, for cells in "real-life" situations of growth and division. We seek to bridge the gap between the current simple models and naturally occurring gene networks. Integration of high-level theoretical work with experiments makes this a very exciting proposal.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Bakteriologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
FP6-2004-MOBILITY-11
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
EDINBURGH
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.