Objectif
Pathogens exploit cellular resources for their own benefit and their propagation. Co-evolution of viruses and their hosts led to the establishment of very specific interactions between both partners. The balance between both, the viral attack and the cellular defense mechanisms, dictates the outcome of an infection, either leading to a cure, to disease or life-long co-existence. Efforts from many laboratories have focused on virus-host interactions, mostly by testing isolated protein-protein interactions or by employing transcriptome analysis. Although this undoubtedly has been highly valuable to our knowledge on virus-host interactions, it is also clear that most virus-host interactions do not occur on transcriptome level and neither involve single protein-protein interactions. Here I propose to systematically test the impact of virus infection on the host proteome (iViP) by using the newest generation of mass spectrometry-based discovery tools combined with infection biology. iViP divides in three interconnected parts that individually and collectively warrant success: Part I evaluates changes in the abundance of the proteins after virus infection and correlates this to mRNA levels, determined by RNA sequencing. Part II identifies proteome-wide post-translational modifications that would be indicative for an involvement in infection biology. Part III dissects the role of virus stimulated/altered proteins in the antiviral protein-protein interaction network. Lastly, identified proteins will be validated in a two –step procedure involving a large-scale validation strategy and further focusing on few selected interactors. A comprehensive coherent data set describing and functionally explaining the cellular changes after encounter of a variety of viral pathogens on a proteome level would complement or even succeed currently available data sets and become invaluable to basic and translational research of the future.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences biologiques biologie de l'évolution
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2012-StG_20111109
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
80539 MUNCHEN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.