Objectif
Achieving a quantitative understanding of the transcriptome is critical to the development of RNA biology and RNA-based therapeutics. One of the main “road-blocks” to the advancement of these fields is the inability, at present, to dynamically track most RNA molecules in vivo. In order to achieve a quantitative understanding of RNA interactions in vivo, we propose to develop a new class of genetically encoded fluorescent probes that will be designed to dynamically track gene expression (mRNA), miRNA trans-interactions, riboswitch or hairpin-type cis-interactions, ribozyme, and any other class of ncRNA.
The probes will consist of large self-assembled RNA-FP complexes that will report RNA-RNA interaction dynamically via an engineered structural change that will be detected through a change in fluorescence. The signal will consist of a change in the light polarization, and will be detected by a novel implementation of a polarization Total Internal Reflection Fluorescence (polTIRF) microscope design, which will enable the detection of small structural changes within the nanoprobe at fast sampling rates.
In this proposal, I intend to develop, in bacteria, the first generation of these probes. Development of the probes and the imaging apparatus will take place simultaneously, in order to optimize both detection capability and the probe design. The development and demonstration of the probes' capabilities will be guided by three objectives, each divided into individual milestones and sub-projects. In particular, I intend to use this approach to quantitatively characterize synthetic hammerhead ribozyme trans interaction, cis-acting RNA thermosensors, and the Hfq RNA-protein complex. I believe that successful implementation of this combined molecular and imaging tool to quantitatively characterize the kinetics associated with RNA-RNA trans/cis-interactions will constitute a proof-of-principle to the broad applicability for our method to other RNA-based platforms.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2012-CIG
Voir d’autres projets de cet appel
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
32000 Haifa
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.