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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-06-18

Mapping structural variation on native chromosomal DNA – a single molecule approach

Ziel

This proposal seeks to utilize single molecule optical detection to directly visualize and analyze genome structural and copy number variation (SVs & CNVs) spanning up to hundreds kb of native chromosomal DNA . The project focuses on a pathogenic macro satellite repeat in the subtelomere of chromosome 4q that is linked to the third most common inherited muscular dystrophy, Facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD). Specific sequences on subtelomeres are labeled with fluorescent molecules via enzymatic reactions to create a unique, chromosome specific fluorescence pattern. The DNA is then stretched in thousands of parallel nanochannels by electrophoresis and imaged on a fluorescence microscope. The resulting patterns along the DNA backbone are compared to a reference map computed from the known genome sequence and variations from the reference are classified and characterized. Specifically, we will be able to count the exact number of repeat blocks in pathogenic vs. non-pathogenic chromosomes. The immediate outcome of this project is a powerful diagnostic tool for FSHD and a proof of principle for single molecule, high throughput structural variation analysis on a genomic scale.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP7-PEOPLE-2012-CIG
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)

Koordinator

TEL AVIV UNIVERSITY
EU-Beitrag
€ 100 000,00
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
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