Objetivo
The evolution of protein interactions has produced interaction networks and much biological complexity. Although molecular phylogenetics reveals the end points of evolutionary searches, little is known about the trajectories of interacting proteins through sequence space over evolutionary time. A major bottleneck is the inability to extensively map how binding affinity changes with sequence. A previously developed affinity prediction model will be modified to predict affinity changes upon mutation. Preliminary results show that this method has unprecedented speed and accuracy. In the proposed research, the preliminary models will be improved and thoroughly validated. Subsequently, they shall be used to assess millions of combinations of interface mutations in structurally annotated interaction networks. The mutational robustness of interactions will be determined, compared with theoretical models, and its relationships with observed evolutionary rates investigated at the amino acid, interface, protein and network levels. Then, paths connecting orthologs to each other and to ancestral protein reconstructions will be determined and characterised. The positions on the phylogenetic trees where the affinity imbuing contacts are gained will be determined, as well as the positions where interactions are lost, revealing network rewiring. This will illuminate the changes in interactions over time, and show how interface biophysics constrains the functionally viable paths available for interaction evolution. The relationships between extent of constraint, evolutionary rates and network properties will be investigated. We hypothesise that the inherent ability to form interactions and modulate specificity can explain a number of observations garnered from network evolution studies. Finally, the human-virus exogenous interaction network will be investigated, potentially revealing strategies and counterstrategies employed as viruses vie to hijack regulatory mechanisms.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias naturales ciencias biológicas biofísica
- ciencias naturales ciencias químicas química orgánica aminas
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
08034 BARCELONA
España
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.