Obiettivo
The evolution of protein interactions has produced interaction networks and much biological complexity. Although molecular phylogenetics reveals the end points of evolutionary searches, little is known about the trajectories of interacting proteins through sequence space over evolutionary time. A major bottleneck is the inability to extensively map how binding affinity changes with sequence. A previously developed affinity prediction model will be modified to predict affinity changes upon mutation. Preliminary results show that this method has unprecedented speed and accuracy. In the proposed research, the preliminary models will be improved and thoroughly validated. Subsequently, they shall be used to assess millions of combinations of interface mutations in structurally annotated interaction networks. The mutational robustness of interactions will be determined, compared with theoretical models, and its relationships with observed evolutionary rates investigated at the amino acid, interface, protein and network levels. Then, paths connecting orthologs to each other and to ancestral protein reconstructions will be determined and characterised. The positions on the phylogenetic trees where the affinity imbuing contacts are gained will be determined, as well as the positions where interactions are lost, revealing network rewiring. This will illuminate the changes in interactions over time, and show how interface biophysics constrains the functionally viable paths available for interaction evolution. The relationships between extent of constraint, evolutionary rates and network properties will be investigated. We hypothesise that the inherent ability to form interactions and modulate specificity can explain a number of observations garnered from network evolution studies. Finally, the human-virus exogenous interaction network will be investigated, potentially revealing strategies and counterstrategies employed as viruses vie to hijack regulatory mechanisms.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia virologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche biofisica
- scienze naturali scienze chimiche chimica organica ammine
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
08034 BARCELONA
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.