Objectif
It is now know that the mammalian genome encodes many thousands of long non-coding RNAs (lncRNAs, >200nt long), some of which are implicated in human pathogenesis including cancers. A subset of lncRNAs such as HOTAIR and ANRIL are overexpressed in several cancers and play roles in epigenetic gene regulation during carcinogenesis, mainly by recruiting chromatin modifier complexes to their target loci. Interestingly, recent studies indicate that some lncRNAs including ANRIL bind to and act together with other chromatin binding proteins (CBPs) that recognize specific histone modifications. However, lncRNA research is still in its infant stage and physical and functional links among lncRNAs, CBPs and histone modifications have not yet been studied extensively. Moreover, considering the facts that the levels of some CBPs change during carcinogenesis, it is likely that different repertoires of lncRNAs-CBP complexes exist in normal and cancer cells.
Based on these facts, I hypothesize that cell type-specific repertoires of lncRNA-CBP complexes lead to altered readouts of specific histone modifications and ultimately contribute to formation/progression of cancer. Using breast cancer cell lines as model systems, I aim to identify repertoires of lncRNA-CBP complexes associated with cancer-related histone modifications (methyl-H3Lys9/27) in normal and cancer cells and unravel their oncogenic or tumour suppressor functions in vivo using proteomics, genomics, molecular and cell biology approaches. In particular, I will develop a novel, highly versatile method for efficient identification of multiple lncRNA-CBP complexes, by combining photo-mediated RNA crosslinking to proteins, nucleosome-based pulldown and quantitative SILAC mass spectrometry. I believe that the outcome of this project will provide novel and deeper insights into the interplay among lncRNAs, CBPs and histone modifications in carcinogenesis, which can be applied to translational medicine in the future.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
80539 MUNCHEN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.