Obiettivo
It is now know that the mammalian genome encodes many thousands of long non-coding RNAs (lncRNAs, >200nt long), some of which are implicated in human pathogenesis including cancers. A subset of lncRNAs such as HOTAIR and ANRIL are overexpressed in several cancers and play roles in epigenetic gene regulation during carcinogenesis, mainly by recruiting chromatin modifier complexes to their target loci. Interestingly, recent studies indicate that some lncRNAs including ANRIL bind to and act together with other chromatin binding proteins (CBPs) that recognize specific histone modifications. However, lncRNA research is still in its infant stage and physical and functional links among lncRNAs, CBPs and histone modifications have not yet been studied extensively. Moreover, considering the facts that the levels of some CBPs change during carcinogenesis, it is likely that different repertoires of lncRNAs-CBP complexes exist in normal and cancer cells.
Based on these facts, I hypothesize that cell type-specific repertoires of lncRNA-CBP complexes lead to altered readouts of specific histone modifications and ultimately contribute to formation/progression of cancer. Using breast cancer cell lines as model systems, I aim to identify repertoires of lncRNA-CBP complexes associated with cancer-related histone modifications (methyl-H3Lys9/27) in normal and cancer cells and unravel their oncogenic or tumour suppressor functions in vivo using proteomics, genomics, molecular and cell biology approaches. In particular, I will develop a novel, highly versatile method for efficient identification of multiple lncRNA-CBP complexes, by combining photo-mediated RNA crosslinking to proteins, nucleosome-based pulldown and quantitative SILAC mass spectrometry. I believe that the outcome of this project will provide novel and deeper insights into the interplay among lncRNAs, CBPs and histone modifications in carcinogenesis, which can be applied to translational medicine in the future.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2012-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
80539 MUNCHEN
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.