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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-18

Quantitative network-level analysis of stochastic cell fate decisions

Objetivo

In a developing embryo, each cell has to assume the correct cell fate to yield a viable adult organism. It has become clear that the signaling networks that control development are heavily influenced by molecular noise, i.e. stochastic fluctuations on the molecular level. Intriguingly, in many organisms cell fates are assigned in a stochastic manner. Such stochastic cell fate decisions are thought to exploit molecular noise, using positive feedback loops to amplify noise into an all-or-nothing cell fate decision. Yet, how a stochastic process results in robust cell fate assignment without errors is poorly understood.

To address this question, we propose to study stochastic cell fate decisions in the nematode C. elegans using a new quantitative, physics-inspired approach. To this end we will use two innovative techniques to quantify the stochastic dynamics of the signaling networks controlling the cell fate decisions. First, we will use single molecule Fluorescence In Situ Hybridization to measure gene expression with unparalleled single-mRNA resolution. Secondly, we will construct a novel microfluidic setup that for the first time will allow high-throughput timelapse microscopy of developmental processes in live C. elegans animals at the single cell level.

Using these techniques in combination with mathematical modeling, we will elucidate the core features of the signaling network essential for robust stochastic cell fate assignment. We will apply this approach to study two stochastic cell fate decisions occurring in gonad development: 1) the so-called AC/VU decision, a classical stochastic cell fate decision that is well-characterized on the molecular level, allowing us to fully focus on how feedback loops reliably amplify noise into all-or-none cell fate decisions. 2) Stochastic vulva precursor cell specification. In this relatively underexplored system, we will apply our insight gained in studying the AC/VU decision to identify the essential feedback loops.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

ERC-2013-StG
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Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Institución de acogida

STICHTING NEDERLANDSE WETENSCHAPPELIJK ONDERZOEK INSTITUTEN
Aportación de la UE
€ 1 495 920,00
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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Beneficiarios (1)

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