Objectif
Proteases are large group of proteins that cleave the amide bond in peptides and proteins. Common properties of all these proteases is the activation of water molecules for catalysis and that the proteins undergo conformational changes upon substrate binding.
Hence it came as a surprise when membrane embedded proteases was identified. Proteases residing in the membrane should be able to create a microenvironment for water and the hydrophilic residues required for catalysis and should be capable of bending o r unwinding hydrophobic substrates making them suitable for cleavage.
Membrane proteases have been implicated in different processes such as cellular differentiation, in unfolded protein response, lipid metabolism, signal peptide processing and, in prokaryotes, generation of peptide pheromones and response to extracellular stress.
These have been collectively termed as Regulated Intramembrane Proteolysis (RIP), which has emerged as a novel mechanism in cell signalling. Some transmembrane proteins are kept inactive in their membrane-tethered form and require proteolysis for activation. Intramembrane proteolysis results in the release of these domains that move to a new location where they can carry out their biological function.
Two of the well-studied membrane proteases include the rhomboid proteases involved in the Drosophila EGF receptor pathway and the g-secretase implicated in the processing of amyloid precursor protein (APP) implicated in Alzheimers disease. The membrane proteins belonging to this family have similar catalytic residues as some of the classical soluble proteases.
This raises the question how these conserved amino acids embedded in the lipid bilayer have access to and activate water that is required for catalysis, and how the substrate is recruited. To understand this we would like to obtain high-resolution structures of a membrane protease and study the mechanism of intra-membrane proteolysis.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire signalisation cellulaire
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule lipides
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse
- sciences naturelles sciences chimiques chimie organique amines
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2005-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
LONDON
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.