Ziel
Proteases are large group of proteins that cleave the amide bond in peptides and proteins. Common properties of all these proteases is the activation of water molecules for catalysis and that the proteins undergo conformational changes upon substrate binding.
Hence it came as a surprise when membrane embedded proteases was identified. Proteases residing in the membrane should be able to create a microenvironment for water and the hydrophilic residues required for catalysis and should be capable of bending o r unwinding hydrophobic substrates making them suitable for cleavage.
Membrane proteases have been implicated in different processes such as cellular differentiation, in unfolded protein response, lipid metabolism, signal peptide processing and, in prokaryotes, generation of peptide pheromones and response to extracellular stress.
These have been collectively termed as Regulated Intramembrane Proteolysis (RIP), which has emerged as a novel mechanism in cell signalling. Some transmembrane proteins are kept inactive in their membrane-tethered form and require proteolysis for activation. Intramembrane proteolysis results in the release of these domains that move to a new location where they can carry out their biological function.
Two of the well-studied membrane proteases include the rhomboid proteases involved in the Drosophila EGF receptor pathway and the g-secretase implicated in the processing of amyloid precursor protein (APP) implicated in Alzheimers disease. The membrane proteins belonging to this family have similar catalytic residues as some of the classical soluble proteases.
This raises the question how these conserved amino acids embedded in the lipid bilayer have access to and activate water that is required for catalysis, and how the substrate is recruited. To understand this we would like to obtain high-resolution structures of a membrane protease and study the mechanism of intra-membrane proteolysis.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Zellbiologie Zellkommunikation
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Lipide
- Naturwissenschaften Chemiewissenschaften Katalyse
- Naturwissenschaften Chemiewissenschaften organische Chemie Amine
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Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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FP6-2005-MOBILITY-5
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
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Koordinator
LONDON
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.