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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-05-29

Design and evaluation of an oligonucleotide microarray for the detection of signature microorganisms in composts from anaerobic digestion of biowastes

Objetivo

The European Community produces every year 200 million tonnes of biodegradable wastes, which have to be diverted from land-filling according to European laws. Biological digestion, either aerobic or anaerobic, is the most environmentally favourable option f or the recycling of biowastes. Composts resulting from these processes are used as soil improvers, which, among other benefits, exert plant disease supressiveness due to the presence of microorganisms that are antagonists to pathogens. However, improperly treated composts may spread pathogenic microorganisms, thus damaging the environment and posing risks to human health. This causes concern among the general public, especially after the food alerts during the last decade, and constitutes a priority issue within the European Research Area.

Therefore, a tool that allows the quick analysis of compost microbiota is needed to safeguarde its agronomic value. DNA biochip technology offers the possibility to simultaneously detect an entire array of micro-organisms. The host group has recently designed a micro-array addressed towards compost microbiota. This proposal aims to design an oligonucleotide micro-array to detect signature microorganisms in composts from anaerobic digestion. Micro-organisms that will be isolated from compost will be targeted. Additional probes will be selected on basis of sequences determined from bands in DGGE gels run with compost DNA. Oligonucleotide probes will be designed using sequence differences in the 16S rDNA gene and printed onto the arrays.

Fluorescently labelled DNA will be prepared and hybridised, and the arrays analysed by fluorescent screening. The validation of the micro-array will be mainly conducted through spiking experiments and through their wide application to already characterised compost samples. If successful, the micro-array might permit assessing whether soil improvers meet hygiene demands, thus increasing their marketability and promoting confidence among European consumers

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP6-2005-MOBILITY-5
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinador

LEOPOLD-FRANZENS-UNIVERSITÄT INNSBRUCK
Aportación de la UE
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Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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