Objectif
This project addresses robustness of phenotypic function on the basis of highly interlinked network topologies on a very practical level: Synthetic Lethality - as proposed for novel cancer treatment regimes. Function in this context is the property of transformed cells to continuously divide, and robustness is encoded by regulatory elements on the genomic and proteomic level triggering drug treatment escape as an emergent property: chemotherapy resistance.
This project will derive novel concepts, methodologies, and their algorithmic implementation for annotation and analysis of general regulatory networks - with particular focus on network robustness and escape routes toward maintaining function. In parallel, computational genomics will be applied on a gene expression data set derived from a unique, systematic collection of chemotherapy resistant cancer cell lines. These real world data encode a set of regulatory escape mechanisms to overcome the lethality imposed by specific drug.
The general concepts and approaches - focusing on dynamical levels - will subsequently be calibrated and merged with results from computational genomics - focusing on a static system representation - to gain insight into the mechanisms of cancer cell robustness, but in particular to identify key proteins of cellular escape mechanisms to overcome lethality of drugs. Blocking these proteins may result in synthetic lethality including re-sensitization of chemoresistant cancer cells to cytotoxic drugs.
To prove the validity of our Complex Systems Analysis approach we will test generated hypotheses on synthetically lethal hubs in the cellular control network via experimental knock down experiments utilizing siRNA. This project will provide further insight into dynamical hierarchies of structure and control on a general level, will calibrate methodologies for their use in computational biology, and will test the validity of these approaches for identifying novel routes in cancer treatment.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2005-NEST-PATH
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
MÜNCHEN
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.