Objectif
Alternative pre-mRNA splicing is a mechanism of regulation of gene expression that affects at least 60% of human genes. Inaddition, at least 15% of genetic defects are associated with aberrant pre-mRNA splicing, an incidence that reaches 40% formulations that inactive genes encoding for example the tumour suppressor BRCA1 or the gene responsible for neurofibromatosis. The molecular mechanisms controlling this process during cell differentiation and development, andtheir alterations in pthological situations are not well understood. Recent work in the host lab has identified a novel mechanism of splicing regulation whereby the regulatory protein Sex-lethal (SXL) inhibits splicing of a specific intone within its own pre-mRNA at the very last step of the splicing reaction (axon legation) (Lillian et al, 2002). This is in contrast with other mechanisms described previously, which target early events in splice site (sis) recognition. The work also revealed a critical role for the splicing factor SPF45 in selecting particular 3\'sis and in allowing regulation by SXL. SPF45 is the first known splicing factor that recognizes directly the 3\' sag and at the same time activates it for catalysis. Interestingly, SPF45 was also found to be involved in the activation of cryptic 3\' sis located upstream from the natural 3\'sis in the ÿ-globing gene. Activation of the cryptic site, which breaks the open reading frame and therefore prevents the mRNA from encoding functional ÿ-globing protein, is caused by a G to A mutation responsible for one form of ÿ-thalassemia (ÿ110). We propose a structural/functional analysis of SPF45 to understand its activities as
(a) second step splicing factor,
(b) selector of 3\' sis AG for catalysis,
(c) mediator of SXL auto regulation and
(d) activator of the cryptic 3\'sis responsible forÿ110-thalassemia. We also intend to use microarray designed to study alternative splicing and RNA interference technology to identify new regulatory genes.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
BARCELONA
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.