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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-05-29

Molecular Mechanisms of Alternative Pre-Mrna Splicing: Function of Spf45 the Its Role in B-Thalassemia

Ziel

Alternative pre-mRNA splicing is a mechanism of regulation of gene expression that affects at least 60% of human genes. Inaddition, at least 15% of genetic defects are associated with aberrant pre-mRNA splicing, an incidence that reaches 40% formulations that inactive genes encoding for example the tumour suppressor BRCA1 or the gene responsible for neurofibromatosis. The molecular mechanisms controlling this process during cell differentiation and development, andtheir alterations in pthological situations are not well understood. Recent work in the host lab has identified a novel mechanism of splicing regulation whereby the regulatory protein Sex-lethal (SXL) inhibits splicing of a specific intone within its own pre-mRNA at the very last step of the splicing reaction (axon legation) (Lillian et al, 2002). This is in contrast with other mechanisms described previously, which target early events in splice site (sis) recognition. The work also revealed a critical role for the splicing factor SPF45 in selecting particular 3\'sis and in allowing regulation by SXL. SPF45 is the first known splicing factor that recognizes directly the 3\' sag and at the same time activates it for catalysis. Interestingly, SPF45 was also found to be involved in the activation of cryptic 3\' sis located upstream from the natural 3\'sis in the ÿ-globing gene. Activation of the cryptic site, which breaks the open reading frame and therefore prevents the mRNA from encoding functional ÿ-globing protein, is caused by a G to A mutation responsible for one form of ÿ-thalassemia (ÿ110). We propose a structural/functional analysis of SPF45 to understand its activities as
(a) second step splicing factor,
(b) selector of 3\' sis AG for catalysis,
(c) mediator of SXL auto regulation and
(d) activator of the cryptic 3\'sis responsible forÿ110-thalassemia. We also intend to use microarray designed to study alternative splicing and RNA interference technology to identify new regulatory genes.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP6-2002-MOBILITY-5
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Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Koordinator

FUNDACIO CENTRE DE REGULACIO GENOMICA
EU-Beitrag
Keine Daten
Adresse
Passeig Maritim 37-49
BARCELONA
Spanien

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Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

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