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Contenuto archiviato il 2024-05-29

The mitochondrial genome of the fish parasite Gyrodactylus salaris - characterization and utility

Obiettivo

Gyrodactylus salaris, an ectoparasitic flatworm (Platyhelmininthes: Monogenea) of the Atlantic salmon, is recognised as a serious problem in all European countries with a Baltic or North Atlantic coastline. The possibility for effective control measures against G. salaris rests on reliable and practical methods of pathogen diagnosis but no strain-specific markers are available to date. Here we propose the full characterization of the mitochondrial genome of G.
salaris and the closely related Macrogyrodactylus polypterus. Comparing both genomes will provide valuable information on the range of variation within the genus, allowing the selection of loci useful at the phylogenetic and population genetic level. Comparing G. salaris populations throughout the distribution range, will allow the design of diagnostic markers based on multiple SNPs. Subsequent optimisation of the SSCP reaction, in order to resolve multiple SNP sites within short mitochondrial fragments will ultimately allow rapid and reliable screening, through ABI Prism SNaPshot Multiplex genotyping. Whilst not the primary aims of the proposal, the results will serve as a basis for phylogenetics, mitogenomics and mitochondrial drug targeting. This proposal underpins an applied problem and therefore provides a real link between a modern biological(genomic) approach and an increasingly important research area worldwide, namely animal health and environmental monitoring. The proposal is founded in the fields of genomic, biotechnology as applied to(animal) health and sustainable development, providing the applicant a first rate training in a wide variety of molecular techniques. The applicant is a well-trained evolutionary biologist with expertise in morphology, enhances and greatly develops ine skills or we applicant-allowing ner to pursue research in modern molecular ecology, parasitology and molecular systematics.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP6-2002-MOBILITY-5
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Coordinatore

THE NATURAL HISTORY MUSEUM
Contributo UE
Nessun dato
Indirizzo
Cromwell Road
LONDON
Regno Unito

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Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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